Ученые 20 стран работали над расшифровкой генома пшеницы мягкой, той самой, которая используется для выпечки хлеба.
Понадобилось десятилетие, чтобы результат был достигнут. Теперь известно, почему он дался так сложно. Геном пшеницы более чем в пять раз превышает человеческий, при этом в каждой клетке находится по шесть копий каждой хромосомы. В результате геном состоит из 16-17 миллиардов пар оснований. Об этом рассказывает статья в журнале GigaScience.
Стивен Сальцберг из Университета Джонса Хопкинса, соавтор исследований, рассказал: «Геном пшеницы очень сложен не только из-за своего размера, но также и потому, что на 80% состоит из повторяющихся последовательностей. Это обстоятельство особо затрудняет работу, так как машины-секвенаторы за один раз прочитывают небольшие фрагменты, которые затем надо объединять в более длинные, причем повторяющиеся участки сильно запутывают этот процесс».
Известно, что в новой работе коллектив биологов использовал секвенаторы, выдающие очень длинные последовательности, до 10 000 нуклеотидов. В результате получился почти неразрывный геном длиной 15,3 миллиарда генетических букв.
Данные должны помочь селекционерам вывести устойчивые к изменению климата сорта.